Blue Lagoon is een gebiedscontrole- en set-collection spel waarin spelers een groep kolonisten beheren die zich uitspreiden over eilanden van een nieuw ontdekte archipel.
Het spel wordt gespeeld in twee fasen (de verkenningsfase gevolgd door de afrekeningsfase). In beide fasen breidt je jouw aanwezigheid op het bord uit door elke beurt een nieuw token toe te voegen (een kolonist of een dorpstoken). Het doel is om de bronnen verspreid over de kaart te verzamelen door je tokens erbovenop te plaatsen. In de eerste fase kun je overal waar je maar wilt een nieuw token plaatsen, zolang het maar de lagune OF een van je eerder gespeelde tokens raakt. In de tweede fase wordt het bord leeggemaakt, behalve de dorpen, en nu kun je alleen uitbreiden vanuit de dorpen die je in de eerste fase hebt gespeeld! Aan het einde van beide fasen scoren spelers punten voor de verzamelingen bronnen die ze hebben verzameld.